La basilique constitue le plus important témoignage de l'art paléochrétien à Milan : les pierres sur lesquelles repose les fondations sont les restes de l'amphithéâtre romain dont on peut apercevoir des traces visibles dans l'actuelle Conca del Naviglio.
La première construction de la basilique remonte au IV siècle d. C. Elle subit quelques transformations romanes au cours du XII siècle pour ensuite être reconstituée de Martino Bassi après l’effondrement de la coupole en 1573
La façade fut modifiée en1894. Face à la façade s’érigent 16 colonnes d'âge impérial, faisant peut-être partie d'un temple (ou de bains public), durant le IV siècle.